RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINA4P29622 427 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR7P32248 378 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGAP37287 484 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 B4GALNT1Q00973 533 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CREMQ03060 361 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHA8Q96JA3 519 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL15Q9NXU5 204 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PLK4O00444 970 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN6P29350 595 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NETO1Q8TDF5 533 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LMLNQ96KR4 655 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PARVBQ9HBI1 364 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GNGT2O14610 69 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C21orf59P57076 290 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SCRN2Q96FV2 425 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ADNPQ9H2P0 1102 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ITM2BQ9Y287 266 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IRAK3Q9Y616 596 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CBFA2T3O75081 653 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-EP13747 358 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IL7RP16871 459 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF12P17014 697 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTM2P28161 218 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DCTP40126 519 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BMXP51813 675 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PTSQ03393 145 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNAB2Q13303 367 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf141Q5SZD1 244 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPESP1Q6UW49 350 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF555Q8NEP9 628 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5K1Q8NHB7 308 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SGCDQ92629 289 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NRBF2Q96F24 287 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 COPS8Q99627 209 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 INPP5KQ9BT40 448 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LHPPQ9H008 270 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 WASH3PC4AMC7 463 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPS2P11908 318 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPH2P23942 346 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 S100A3P33764 101 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC44A4Q53GD3 710 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPARTQ8N0X7 666 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NCLNQ969V3 563 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PSME2Q9UL46 239 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIL1Q9Y3C6 166 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINA1P01009 418 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TFPTP0C1Z6 253 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IMPDH2P12268 514 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GBX1Q14549 363 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ARSIQ5FYB1 569 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MPP7Q5T2T1 576 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2A12Q8NGT7 310 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ECHDC3Q96DC8 303 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ITCHQ96J02 903 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TACR1P25103 407 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 AOAHP28039 575 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MEP1AQ16819 746 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LAIR2Q6ISS4 152 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CHPFQ8IZ52 775 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 EID3Q8N140 333 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms