RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.55■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 IGLV3-19P01714 112 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 ERGP11308 486 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 BCKDHAP12694 445 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 HSD17B2P37059 387 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PRKCQQ04759 706 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 RCN1Q15293 331 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TLR1Q15399 786 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 CCDC6Q16204 474 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 ATG9BQ674R7 924 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 ANO7Q6IWH7 933 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 OR7G3Q8NG95 312 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 SLC5A11Q8WWX8 675 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 WDR34Q96EX3 536 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 APIPQ96GX9 242 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 FERD3LQ96RJ6 166 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 SLC39A3Q9BRY0 314 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 EBF2Q9HAK2 575 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.54■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 SCAMP1O15126 338 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 APBB3O95704 486 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 HTR1BP28222 390 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 AKT2P31751 481 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 CCNIQ14094 377 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MED27Q6P2C8 311 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 LCTLQ6UWM7 567 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 OR1E3Q8WZA6 343 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 LRRC58Q96CX6 371 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 OR2M4Q96R27 311 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MENTQ9BUN1 341 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 EHD1Q9H4M9 534 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 CYP8B1Q9UNU6 501 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 C10orf142B7Z368 130 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TRIM38O00635 465 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 AMD1P17707 334 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 LRRC32Q14392 662 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 CLCA4Q14CN2 919 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 CYP2A13Q16696 494 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PAGE3Q5JUK9 113 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 NXPE4Q6UWF7 544 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 NUDT8Q8WV74 236 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PDXPQ96GD0 296 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 WDR92Q96MX6 357 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 GUCD1Q96NT3 240 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB18Q99592 522 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 NRTNQ99748 197 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 HAUS8Q9BT25 410 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 DPY30Q9C005 99 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 BRF2Q9HAW0 419 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.53■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 ZNF839A8K0R7 811 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PDZK1P1A8MUH7 402 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 FXYD1O00168 92 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PRPS2P11908 318 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PCNAP12004 261 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 HSD3B1P14060 373 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 HSD3B2P26439 372 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 NFYCQ13952 458 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 UAP1L1Q3KQV9 507 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 ADNP2Q6IQ32 1131 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 JADE3Q92613 823 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 REPS1Q96D71 796 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
UPP1-201ENST00000331803 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.51■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 MAPK1P28482 360 aa18.51■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SLC7A2P52569 658 aa18.51■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 YPEL5P62699 121 aa18.51■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 MS4A2Q01362 244 aa18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms