RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PCBD2Q9H0N5 130 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CENPHQ9H3R5 247 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 BTRCQ9Y297 605 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TNFSF15O95150 251 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GRIA3P42263 894 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ZIC1Q15915 447 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CDKL4Q5MAI5 379 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 LCA5Q86VQ0 697 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ESAMQ96AP7 390 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 TCTN2Q96GX1 697 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 OR6C1Q96RD1 312 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 DPH7Q9BTV6 452 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TK2O00142 265 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TAPBPO15533 448 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 WDR47O94967 919 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MTHFD2P13995 350 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GFAPP14136 432 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FOLR1P15328 257 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GDF5P43026 501 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 HSPA7P48741 367 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CASP8Q14790 479 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 LCTLQ6UWM7 567 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TRABD2AQ86V40 505 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 BMPERQ8N8U9 685 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ZUFSPQ96AP4 578 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FAM60AQ9NP50 221 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FRYQ5TBA9 3013 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MAP2K7O14733 419 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GLRA3O75311 464 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GSTA1P08263 222 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 NPPBP16860 134 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 TUBB3Q13509 450 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 RTP5Q14D33 572 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GPR19Q15760 415 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FCRL6Q6DN72 434 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf46Q6P387 395 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 C17orf64Q86WR6 236 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 OR4K3Q96R72 315 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 HAUS8Q9BT25 410 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 B4E171 279 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TARM1B6A8C7 271 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 COPEO14579 308 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN7P41732 249 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A12P48065 614 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CCT5P48643 541 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ACY1Q03154 408 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 NAA25Q14CX7 972 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PFKFB4Q16877 469 aa21.47■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CROCCP2Q86T23 111 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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HOXD4-201ENST00000306324 APMAPQ9HDC9 416 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FGF21Q9NSA1 209 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 H7BY64 318 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 NRP2O60462 931 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 BRINP1O60477 761 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM24O75264 130 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 STK16O75716 305 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 GGT5P36269 586 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 AGTR2P50052 363 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 LSMEM2Q8N112 164 aa21.46■■□□□ 1.03
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