RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 HSD3B1P14060 373 aa14.83□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 NANOGQ9H9S0 305 aa14.82□□□□□ -0.04
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SF3B4-201ENST00000271628 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.82□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 ASF1AQ9Y294 204 aa14.82□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.82□□□□□ -0.04
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SF3B4-201ENST00000271628 CD22P20273 847 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 KELP23276 732 aa14.81□□□□□ -0.04
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SF3B4-201ENST00000271628 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 METRNLQ641Q3 311 aa14.81□□□□□ -0.04
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SF3B4-201ENST00000271628 SGK2Q9HBY8 427 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 AQP12BA6NM10 295 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 DGKQP52824 942 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 NR1H2P55055 460 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 TAP2Q03519 686 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 APOFQ13790 326 aa14.81□□□□□ -0.04
SF3B4-201ENST00000271628 PON2Q15165 354 aa14.81□□□□□ -0.04
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