RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 INSL5Q9Y5Q6 135 aa17.17■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 OR1I1O60431 355 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TIE1P35590 1138 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 IL18Q14116 193 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 GANABQ14697 944 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 EURLQ9NYK6 297 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RIIAD1A6NNX1 92 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 SOCS5O75159 536 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RASGRP1O95267 797 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 KHKP50053 298 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CCR8P51685 355 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 OAFQ86UD1 273 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 FBXL20Q96IG2 436 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 PHF12Q96QT6 1004 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 MAGEE1Q9HCI5 957 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM9Q9P0T7 183 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF222Q9UK12 451 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 COCHO43405 550 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 SNX4O95219 450 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 GJB5O95377 273 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ACRP10323 421 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 IL7RP16871 459 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ARSDP51689 593 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RANBP10Q6VN20 620 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TTLQ8NG68 377 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM39Q9HCM9 518 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 B4GALT6Q9UBX8 382 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 EDN1P05305 212 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CDK6Q00534 326 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 GRIK2Q13002 908 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 NFATC2Q13469 925 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 USP43Q70EL4 1123 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 SLC15A3Q8IY34 581 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TDP1Q9NUW8 608 aa17.16■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0G2JN53 185 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 MEIS3P2A8K0S8 358 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 AREL1O15033 823 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 T-ENOLP0DO92 83 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 MAGEA6P43360 314 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TMC8Q8IU68 726 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 LMLNQ96KR4 655 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 GPR62Q9BZJ7 368 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM138Q9NPI0 162 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 DIABLOQ9NR28 239 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 POFUT2Q9Y2G5 429 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 POP7O75817 140 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 PCDH1Q08174 1060 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CARTPTQ16568 116 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 KLHL22Q53GT1 634 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 LDLRAD1Q5T700 205 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 PIK3R3Q92569 461 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 TBX1O43435 398 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CLIC3O95833 236 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 KLK1P06870 262 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CNKSR3Q6P9H4 555 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF783Q6ZMS7 281 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF366Q8N895 744 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 IRAK3Q9Y616 596 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RYKP34925 604 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 OMPP47874 163 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 NDUFA9Q16795 377 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CRB2Q5IJ48 1285 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CADM2Q8N3J6 435 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 OR5AK3PQ8NH89 298 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF563Q8TA94 476 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SCARB2-201ENST00000264896 CLDN4O14493 209 aa17.14■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 SOD2P04179 222 aa17.14■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 PRKACGP22612 351 aa17.14■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 SP140Q13342 867 aa17.14■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 NDUFA5Q16718 116 aa17.14■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 ZFP69Q49AA0 526 aa17.14■□□□□ 0.33
SCARB2-201ENST00000264896 SYVN1Q86TM6 617 aa17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms