RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 NUDT6P53370 316 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 NPRL3Q12980 569 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 UPP1Q16831 310 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 CCDC58Q4VC31 144 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 GPR153Q6NV75 609 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 UBQLNLQ8IYU4 475 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 ST6GAL2Q96JF0 529 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 VPS4AQ9UN37 437 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 SLC12A8A0AV02 714 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 ARL5CA6NH57 179 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 TBX18O95935 607 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 F2P00734 622 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 TP53BP2Q13625 1128 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 E2F2Q14209 437 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 SNAP47Q5SQN1 464 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 RGL4Q8IZJ4 473 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D20Q96BZ9 403 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 RMDN1Q96DB5 314 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 PTPN18Q99952 460 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 RIMKLBQ9ULI2 386 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 TLR6Q9Y2C9 796 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 COMMD10Q9Y6G5 202 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 A3GALT2U3KPV4 340 aa19.96■□□□□ 0.79
PMS1-222ENST00000639501 E5RI56 91 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 TAPBPO15533 448 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 SEMA3DO95025 777 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 MED26O95402 600 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 OTCP00480 354 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ODC1P11926 461 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 MC4RP32245 332 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 TBX4P57082 545 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 MFSD10Q14728 455 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 NRARPQ7Z6K4 114 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 GPRC5BQ9NZH0 403 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CENPBD1B2RD01 187 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 RGS14O43566 566 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 EPOP01588 193 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 GPR15P49685 360 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ARHGDIAP52565 204 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 LIMK1P53667 647 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CDK10Q15131 360 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 LRIF1Q5T3J3 769 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ZNF544Q6NX49 715 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 HORMAD1Q86X24 394 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 KCNC2Q96PR1 638 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 SNX18Q96RF0 628 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 TTYH2Q9BSA4 534 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 TAS2R16Q9NYV7 291 aa19.95■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CTDSP2O14595 271 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 B3GAT3O94766 335 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 PTHP01270 115 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 SEMG1P04279 462 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 HMBSP08397 361 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 BCKDHAP12694 445 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA11P43364 429 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CLCN7P51798 805 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CYP4F2P78329 520 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 IRF3Q14653 427 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 DDR2Q16832 855 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ZFP69Q49AA0 526 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 DOK6Q6PKX4 331 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 SCN4BQ8IWT1 228 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ABCG8Q9H221 673 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 LRTM1Q9HBL6 345 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 E9PQ18 207 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 FFAR2O15552 330 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 PRAMEF11O60813 436 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 FABP3P05413 133 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ITGB1P05556 798 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ADORA3P0DMS8 318 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 GNPDA1P46926 289 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 CACHD1Q5VU97 1274 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 AGMOQ6ZNB7 445 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 ZNF675Q8TD23 568 aa19.94■□□□□ 0.78
PMS1-222ENST00000639501 FCGR1BQ92637 280 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms