RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 C10orf111Q8N326 155 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PJA1Q8NG27 643 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GPR152Q8TDT2 470 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 LPPQ93052 612 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 A8MX80 341 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 I3L521 148 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PIRO00625 290 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SLC16A6O15403 523 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 AP2A2O94973 939 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PSKH1P11801 424 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MYL9P24844 172 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 AIF1P55008 147 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 VLDLRP98155 873 aa6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 SCAPQ12770 1279 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GTF2H2Q13888 395 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FAM187BQ17R55 369 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SPATS1Q496A3 300 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 KDELC1Q6UW63 502 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SLC34A3Q8N130 599 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 MED30Q96HR3 178 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TSGA13Q96PP4 275 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PANX1Q96RD7 426 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 OR1E2P47887 323 aa6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PMEPA1Q969W9 287 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 COQ8BQ96D53 544 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 APOLD1Q96LR9 279 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 OR5M11Q96RB7 305 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 EBPLQ9BY08 206 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ACTL8Q9H568 366 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ELP3Q9H9T3 547 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SPASTQ9UBP0 616 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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