RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 HPP00738 406 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 KLC1Q07866 573 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM214AQ32MH5 1076 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP9Q7RTR0 991 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS58Q8IYP2 241 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZUFSPQ96AP4 578 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf44Q96CB5 159 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 AMFRQ9UKV5 643 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD4Q9Y227 616 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CSMD1Q96PZ7 3565 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 HYKKA2RU49 373 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TARM1B6A8C7 271 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SUN1O94901 812 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS8O95995 478 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 STSP08842 583 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRA1DP25100 572 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 BDKRB1P46663 353 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEP78395 509 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CCSMST1Q4G0I0 132 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX26Q7Z412 305 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FJX1Q86VR8 437 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS50Q96JG6 964 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LMF1Q96S06 567 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MIPEPQ99797 713 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF304Q9HCX3 659 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OLAHQ9NV23 265 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NFS1Q9Y697 457 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LRBAP50851 2863 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP9O95302 570 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZGLP1P0C6A0 271 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ACPPP15309 386 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED2Q15363 201 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4N4Q8N0Y3 316 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 BCORP1Q8N888 145 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MIEF2Q96C03 454 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PANX2Q96RD6 677 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TCAF1Q9Y4C2 921 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK4Q9Y5K2 254 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM169AQ9Y6X4 670 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA12Q86UK0 2595 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK10Q96BY6 2186 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YVX5 310 aa24.47■■□□□ 1.51
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CAPNS1-211ENST00000590874 FTCDO95954 541 aa24.47■■□□□ 1.51
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR2L3Q8NG85 312 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1N1Q8NGS0 311 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD51AP1Q96B01 352 aa24.47■■□□□ 1.51
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf18Q9UK00 162 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 JRKO75564 520 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf105O95561 183 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TDGF1P3P51864 188 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OCA2Q04671 838 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA2Q5GFL6 755 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG9BQ674R7 924 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT9Q6P2P2 845 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF44Q7L0R7 432 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A1Q8NGT9 310 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMF1Q92530 271 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf90Q96M02 699 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY12Q9H244 342 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUH1 482 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPV9 198 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS44E7EML9 344 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 COX6A1P12074 109 aa24.45■■□□□ 1.5
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