RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 GNGT1P63211 74 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ABATP80404 500 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LCP2Q13094 533 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LAPTM5Q13571 262 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 RCN2Q14257 317 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 45.8
SMAD4-210ENST00000590061 ANGPT1Q15389 498 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ALG11Q2TAA5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PLK5Q496M5 336 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SBSNQ6UWP8 590 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PIM3Q86V86 326 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MGARPQ8TDB4 240 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SMPDL3AQ92484 453 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LGR4Q9BXB1 951 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 EPN3Q9H201 632 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SLC32A1Q9H598 525 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 FGF22Q9HCT0 170 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 WWOXQ9NZC7 414 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 OPTCQ9UBM4 332 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MEGF11A6BM72 1044 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ANTXRLA6NF34 631 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 G3V2L1 256 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 K7EPI3 171 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GPR39O43194 453 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LRP3O75074 770 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf105O95561 183 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 FAM107AO95990 144 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 VIPP01282 170 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF883P0CG24 379 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GNAZP19086 355 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ACADLP28330 430 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ACTR1BP42025 376 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GLRBP48167 497 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 SLC1A6P48664 564 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 RAB28P51157 221 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 NAGLUP54802 743 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GYS2P54840 703 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ACTR1AP61163 376 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PHEXP78562 749 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PCDH1Q08174 1060 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ABRQ12979 859 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 FZD2Q14332 565 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF460Q14592 562 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CHI3L2Q15782 390 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 PFKFB4Q16877 469 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM74Q86UV6 250 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms