RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562602.1

CFDP1-202, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CFDP1, Length 699 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-202ENST00000562602 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ATL1Q8WXF7 558 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NCLNQ969V3 563 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 TIFAQ96CG3 184 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NODALQ96S42 347 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 COPS8Q99627 209 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 TOR3AQ9H497 397 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ACTL8Q9H568 366 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 FANCEQ9HB96 536 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 HMG20AQ9NP66 347 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 KLQ9UEF7 1012 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 VPS51Q9UID3 782 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 GABRQQ9UN88 632 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.3□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 MYLKQ15746 1914 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 A0A1B0GTW7 788 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 C9JVG2 144 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 GFRA2O00451 464 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NUAK1O60285 661 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 DFNA5O60443 496 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 TSPAN3O60637 253 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ADAM23O75077 832 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ATE1O95260 518 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 GJB5O95377 273 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 EFEMP2O95967 443 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 CD160O95971 181 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ARAFP10398 606 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 IMPDH2P12268 514 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 BCKDHAP12694 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 CTGFP29279 349 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 OR1D2P34982 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ASMTP46597 345 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ENTPD1P49961 510 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 HTR6P50406 440 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 GALK1P51570 392 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 DGKQP52824 942 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 GSTM4Q03013 218 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 PCDH1Q08174 1060 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 VEZF1Q14119 521 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ARHGEF7Q14155 803 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 PLCL1Q15111 1095 aa7.29□□□□□ -1.24
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CFDP1-202ENST00000562602 NEDD8Q15843 81 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 RGS21Q2M5E4 152 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ZNF691Q5VV52 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 LIPJQ5W064 366 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 SPARTQ8N0X7 666 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 FBXO30Q8TB52 745 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 FCGR1BQ92637 280 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 NELL1Q92832 810 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 MUL1Q969V5 352 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ASIC4Q96FT7 647 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 VMP1Q96GC9 406 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 EXOC2Q96KP1 924 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 ZNF347Q96SE7 839 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 APOL5Q9BWW9 433 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 IL26Q9NPH9 171 aa7.29□□□□□ -1.24
CFDP1-202ENST00000562602 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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