RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 K7ENP7 123 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR2B3O76000 313 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC16A8O95907 504 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGP20916 626 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 AGXTP21549 392 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ARSFP54793 590 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PPM1NQ8N819 430 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR2L3Q8NG85 312 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PMEPA1Q969W9 287 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR22Q99680 433 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRORYQ9H606 182 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ARL15Q9NXU5 204 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SNX7Q9UNH6 387 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PSAT1Q9Y617 370 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC189A1A4V9 331 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 E7ENX8 843 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TXNDC9O14530 226 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RECKO95980 971 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PVRP15151 417 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CRABP2P29373 138 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HNMTP50135 292 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GPX6P59796 221 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP6V0D1P61421 351 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TAP2Q03519 686 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RELAQ04206 551 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ICE2Q659A1 982 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM73Q86UV7 250 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF480Q8WV37 535 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PPM1MQ96MI6 270 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CATSPER2Q96P56 530 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OLFM1Q99784 485 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HAUS8Q9BT25 410 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NDC1Q9BTX1 674 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR87Q9BY21 358 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 L2HGDHQ9H9P8 463 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LHX9Q9NQ69 397 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C9J4A7 227 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EFSO43281 561 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ANXA5P08758 320 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 IMPA1P29218 277 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GRK3P35626 688 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC26A3P40879 764 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIA3P42263 894 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS2R39P59534 338 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB10P61026 200 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CDKL1Q00532 357 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GRM7Q14831 915 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TGIF1Q15583 401 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TRADDQ15628 312 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPH1Q70E73 1250 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR1L3Q8NH93 324 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MIPEPQ99797 713 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms