RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 THEM4Q5T1C6 240 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 USP49Q70CQ1 688 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF605Q86T29 641 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF614Q8N883 585 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 MAP6Q96JE9 813 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SERAC1Q96JX3 654 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MED28Q9H204 178 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FZD8Q9H461 694 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GDE1Q9NZC3 331 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 ENPP3O14638 875 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP5Z1O43299 807 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OLFM2O95897 454 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 SCN1BQ07699 218 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MROH9Q5TGP6 573 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SHEQ5VZ18 495 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OGFOD2Q6N063 350 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PIGZQ86VD9 579 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FICDQ9BVA6 458 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIGARQ9NQ88 270 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 INIPQ9NRY2 104 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VAPAQ9P0L0 249 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ORC5O43913 435 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPRIN2O60269 458 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA17P01571 189 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 APOC3P02656 99 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 NDUFV2P19404 249 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 ALDH9A1P49189 494 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GNG10P50151 68 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 SELPLGQ14242 412 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 BCL2A1Q16548 175 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP6Q16828 381 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRF1Q5T601 910 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HACD4Q5VWC8 232 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MLIPQ5VWP3 458 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPR65Q8IYL9 337 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NID2Q14112 1375 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 STRCQ7RTU9 1775 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DISC1C4P0D8 188 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AURKAO14965 403 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VILLO15195 856 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PIGRP01833 764 aa6.17□□□□□ -1.42
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