RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM160Q9NX00 188 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 DDIT4Q9NX09 232 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PTTG2Q9NZH5 202 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 POLG2Q9UHN1 485 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KCND3Q9UK17 655 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 BAG5Q9UL15 447 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PSAT1Q9Y617 370 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PLXNB2O15031 1838 aa4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 A0A1B0GTW7 788 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KANSL1LA0AUZ9 987 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 A6NCN8 305 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OR2W5A6NFC9 320 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 E9PBE3 544 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNK1O00180 336 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 HAS3O00219 553 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 STX16O14662 325 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PPEF2O14830 753 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIAP1O43715 76 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KLHL41O60662 606 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PIGNO95427 931 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CER1O95813 267 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CLPTM1O96005 669 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PRKCGP05129 697 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MED14OSP0DP75 135 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ODC1P11926 461 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FCGR1AP12314 374 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 UQCRC1P31930 480 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TTKP33981 857 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 GRIA1P42261 906 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 GSTM5P46439 218 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNC1P48547 511 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCR5P51681 352 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 INHBCP55103 352 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 STX1BP61266 288 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ADAM17P78536 824 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MC2RQ01718 297 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CREB5Q02930 508 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 BNIP2Q12982 314 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZBTB17Q13105 803 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 NME3Q13232 169 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF124Q15973 351 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 USP41Q3LFD5 358 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RAB6CQ53S08 254 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PIGGQ5H8A4 983 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 COQ5Q5HYK3 327 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CES4AQ5XG92 561 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MAVSQ7Z434 540 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ARPINQ7Z6K5 226 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SNX32Q86XE0 403 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TERB1Q8NA31 727 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PYDC1Q8WXC3 89 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ROPN1LQ96C74 230 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CDCA5Q96FF9 252 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SENP8Q96LD8 212 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 IL12RB2Q99665 862 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCT7Q99832 543 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ACBD6Q9BR61 282 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.63□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 C20orf27Q9GZN8 174 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms