RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 COX15Q7KZN9 410 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 OVCH1Q7RTY7 1134 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM151BQ8IW70 566 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 PRELID2Q8N945 189 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 OR2L3Q8NG85 312 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NACC2Q96BF6 587 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 TCF12Q99081 682 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ENAMQ9NRM1 1142 aa23.63■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CTSVO60911 334 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ONECUT2O95948 504 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 MMP11P24347 488 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 GBX1Q14549 363 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 KCNJ11Q14654 390 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ARMC3Q5W041 872 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 IQCKQ8N0W5 287 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 TM9SF4Q92544 642 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FAM136AQ96C01 138 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SPSB2Q99619 263 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SLC26A1Q9H2B4 701 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CDC23Q9UJX2 597 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 KLK4Q9Y5K2 254 aa23.62■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FITM1A5D6W6 292 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 MASP2O00187 686 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CHRM3P20309 590 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 GPS1Q13098 491 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NAA25Q14CX7 972 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NKG7Q16617 165 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FAM214AQ32MH5 1076 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CASC4Q6P4E1 433 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FBXL4Q9UKA2 621 aa23.61■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PPV9 198 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 E5RI56 91 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 AVILO75366 819 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 MATN4O95460 622 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ITGA3P26006 1051 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEA6P43360 314 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SOX8P57073 446 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FRMPD2BQ6IN97 320 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 IGFL3Q6UXB1 125 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 RNF44Q7L0R7 432 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 OR2A1Q8NGT9 310 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SLC6A20Q9NP91 592 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CTSFQ9UBX1 484 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0J9YVX5 310 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CMPK1P30085 196 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CILP2Q8IUL8 1156 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NAV2Q8IVL1 2488 aa23.59■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 HYKKA2RU49 373 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF33A8MVX0 844 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SOCS6O14544 535 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NRDCO43847 1150 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NRP2O60462 931 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 KRT14P02533 472 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ERVK-10P10266 1014 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ERGP11308 486 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 OR1D4P47884 311 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CCZ1BP86790 482 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 NEPROQ6NW34 567 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 CENPUQ71F23 418 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ZADH2Q8N4Q0 377 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 OR9A1PQ8NGU1 263 aa23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ALYREF-203ENST00000511412 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms