RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	C2orf81	A6NN90	581 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344		H3BMH7	237 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	AP3B1	O00203	1094 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	SOCS6	O14544	535 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	UNC5C	O95185	931 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	CRTAM	O95727	393 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	CTSB	P07858	339 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	IVD	P26440	423 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	CA7	P43166	264 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBM3-208	ENST00000489344	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	RAD51C	O43502	376 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	KLHL18	O94889	574 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	NPY2R	P49146	381 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ARG2	P78540	354 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	MFAP5	Q13361	173 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ZIC1	Q15915	447 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	MCU	Q8NE86	351 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GTL3	188 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ALAS2	P22557	587 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ADRA1D	P25100	572 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	GABRA4	P48169	554 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	TLE4	Q04727	773 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344		Q0VFX4	171 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	POU6F1	Q14863	301 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	MMP21	Q8N119	569 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM3-208	ENST00000489344	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.26	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms