RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJC22Q8N4W6 341 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM45AQ8TCE6 357 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ASB11Q8WXH4 323 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC30A3Q99726 388 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ACAT2Q9BWD1 397 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX7Q9UNH6 387 aa25.8■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 RECKO95980 971 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 TUBB4AP04350 444 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 C8GP07360 202 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ALAS2P22557 587 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 F8A1P23610 371 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SYVN1Q86TM6 617 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 OR2L3Q8NG85 312 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PKP4Q99569 1192 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PCMTD2Q9NV79 361 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 CDC23Q9UJX2 597 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 VWA7Q9Y334 891 aa25.79■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 RAB40ALP0C0E4 278 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM87AP0C7U9 286 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SAT1P21673 171 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 GRIA3P42263 894 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC12A2P55011 1212 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PLTPP55058 493 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 CAPN12Q6ZSI9 719 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC38A9Q8NBW4 561 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 NLNQ9BYT8 704 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.78■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 E7ESA3 106 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PRB1P04280 392 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PSMB5P28074 263 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 DCDP81605 110 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 GRM7Q14831 915 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PTCHD3Q3KNS1 767 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 LINC00303Q3SY05 128 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 HECTD2Q5U5R9 776 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 C8orf74Q6P047 294 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 PAQR3Q6TCH7 311 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SUSD1Q6UWL2 747 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 STRA8Q7Z7C7 330 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC26A11Q86WA9 606 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC25Q86WR0 208 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 MNS1Q8NEH6 495 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 LINGO1Q96FE5 620 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS39Q96JC1 886 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CCZ1B-211ENST00000486840 KRT87PA6NCN2 255 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 GFYI3L273 518 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC16A8O95907 504 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 POLE2P56282 527 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 SP140Q13342 867 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM214AQ32MH5 1076 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 C1orf189Q5VU69 101 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 MLIPQ5VWP3 458 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 DUPD1Q68J44 220 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 ADCK2Q7Z695 626 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 THAP4Q8WY91 577 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC138Q96M89 665 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 DPH7Q9BTV6 452 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 PARVBQ9HBI1 364 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 MED16Q9Y2X0 877 aa25.76■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC16A5O15375 505 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 GABRB3P28472 473 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 RORAP35398 523 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 CDKN2DP55273 166 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 ABATP80404 500 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 FCRL6Q6DN72 434 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 PCSK4Q6UW60 755 aa25.75■■□□□ 1.71
CCZ1B-211ENST00000486840 CYHR1Q6ZMK1 362 aa25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms