RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMED3Q9Y3Q3 217 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM17Q9Y577 477 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PR80 420 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FEZF1A0PJY2 475 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOCS3O14543 225 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV2-70P01814 119 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHEP01854 428 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKAR1AP10644 381 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSFMP43897 325 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSPB3Q12988 150 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NFATC2Q13469 925 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MOGAT2Q3SYC2 334 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CBWD6Q4V339 395 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CBWD3Q5JTY5 395 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF595Q8IYB9 648 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MINDY1Q8N5J2 469 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2L2Q8NH16 312 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1L3Q8NH93 324 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM20AQ96MK3 541 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOSTQ9BQB4 213 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 THAP2Q9H0W7 228 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PANK3Q9H999 370 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSAG2Q9Y5P2 127 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 C22orf31O95567 290 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 VTNP04004 478 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 DANCRP0C864 163 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PORP16435 677 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPN2P17655 700 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTHFRP42898 656 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 LMAN1P49257 510 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK12P53778 367 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM50BP56557 158 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GSCP56915 257 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBXN2AP68543 259 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 STK4Q13043 487 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CALCOCO2Q13137 446 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF74Q16587 644 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHKG1Q16816 387 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF774Q6NX45 483 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDC20BQ86Y33 519 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8NBF4 154 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10S1Q8NGN2 331 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP8B4Q8TF62 1192 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIGBQ92521 554 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASL10AQ92737 203 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMCO6Q96DC7 493 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDE7BQ9NP56 450 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHST11Q9NPF2 352 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDE1Q9NZC3 331 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR34Q9UPC5 381 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 R4GN57 208 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEMP2A6NFY4 417 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASB14A6NK59 587 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MPTX1A8MV57 137 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNURFLB1AK76 121 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARPC2O15144 300 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 BEST1O76090 585 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOMM70O94826 608 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINGO3P0C6S8 592 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MPZP25189 248 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 HLA-FP30511 346 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 XGP55808 180 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSNK2BP67870 215 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLC1Q07866 573 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 COX10Q12887 443 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 VEZF1Q14119 521 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEA1Q16626 185 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CES4AQ5XG92 561 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMD2Q8IY49 270 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8N377 158 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms