RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 CHRNA6Q15825 494 aa8.66□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-201ENST00000368378 TEX26Q8N6G2 289 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-201ENST00000368378 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.66□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 KRBA1A5PL33 1030 aa8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 SEC24AO95486 1093 aa8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 ALDH2P05091 517 aa8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-201ENST00000368378 POC5Q8NA72 575 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-201ENST00000368378 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-201ENST00000368378 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-201ENST00000368378 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-201ENST00000368378 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.65□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 TPST2O60704 377 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 APOL3O95236 402 aa8.65□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 P3H2Q8IVL5 708 aa8.65□□□□□ -1.03
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THBS3-201ENST00000368378 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 UROC1Q96N76 676 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS3-201ENST00000368378 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.64□□□□□ -1.03
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