RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 MAPK9P45984 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NPRL3Q12980 569 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GALNT3Q14435 633 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 Q3C1V9 767 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GPR33Q49SQ1 333 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CES5AQ6NT32 575 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.3□□□□□ -1.4
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LMO3-202ENST00000320122 TLK2Q86UE8 772 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 C11orf74Q86VG3 221 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 OR8H2Q8N162 312 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 STMN3Q9NZ72 180 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 EHD3Q9NZN3 535 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 STUB1Q9UNE7 303 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 I6L893 689 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PGLSO95336 258 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RHOCP08134 193 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 AGXTP21549 392 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NR4A1P22736 598 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RRM2P31350 389 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SELENBP1Q13228 472 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 VMACQ2NL98 169 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.3□□□□□ -1.4
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LMO3-202ENST00000320122 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RAET1EQ8TD07 263 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CD244Q9BZW8 370 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC22A4Q9H015 551 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 MARCH7Q9H992 704 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SNX7Q9UNH6 387 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CCDC182A6NF36 153 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CLCA1A8K7I4 914 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PSMD11O00231 422 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZNF197O14709 1029 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 UGT2B17O75795 530 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PEX11BO96011 259 aa6.3□□□□□ -1.4
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LMO3-202ENST00000320122 TACR2P21452 398 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 KDELR2P33947 212 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ETV6P41212 452 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 INPP1P49441 399 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 HNMTP50135 292 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 UGT2B15P54855 530 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SMIM11AP58511 58 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NCS1P62166 190 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RBBP4Q09028 425 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ANGPT1Q15389 498 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 UPP1Q16831 310 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 INAVAQ3KP66 663 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FBXL22Q6P050 247 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CD200R1Q8TD46 325 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CREBZFQ9NS37 354 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 NEU3Q9UQ49 428 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 LCTP09848 1927 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 ARL5CA6NH57 179 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 GUCY1B2O75343 617 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-202ENST00000320122 CDK1P06493 297 aa6.29□□□□□ -1.4
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