RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 RNF14Q9UBS8 474 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CTSFQ9UBX1 484 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CACNA1CQ13936 2221 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 A0A087X0T9 212 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 BMP10O95393 424 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CRTAMO95727 393 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MLYCDO95822 493 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SERPING1P05155 500 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SERPINA7P05543 415 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FAM228BP0C875 321 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CD99P14209 185 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 AP2B1P63010 937 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 DYNLT1P63172 113 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 XIAPP98170 497 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 WASHC5Q12768 1159 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 C3AR1Q16581 482 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 GPR33Q49SQ1 333 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 COX15Q7KZN9 410 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SNX20Q7Z614 316 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TRIM58Q8NG06 486 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PSMF1Q92530 271 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MIEF2Q96C03 454 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 DESI2Q9BSY9 194 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.46□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 PJA2O43164 708 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 PRAMEF2O60811 474 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 H2AFZP0C0S5 128 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 MAGP20916 626 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 CXCR2P25025 360 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 OR1D4P47884 311 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ART1P52961 327 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 KLC1Q07866 573 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 SPA17Q15506 151 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 KRTCAP3Q53RY4 240 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ATG9BQ674R7 924 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 H2AFVQ71UI9 128 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 SLC35F6Q8N357 371 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 RNF32Q9H0A6 362 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 TINAGQ9UJW2 476 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 C3orf18Q9UK00 162 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.45□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GTL3 188 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 FAM155BO75949 473 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ANXA9O76027 345 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 AP2A1O95782 977 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 WDPCPO95876 746 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 AGTP01019 485 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 GEMP55040 296 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 CSNK1G2P78368 415 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 KIF5AQ12840 1032 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 MESDQ14696 234 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 LONRF1Q17RB8 773 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 CNSTQ6PJW8 725 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 ZNF567Q8N184 647 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 C8orf44Q96CB5 159 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.44□□□□□ -0.58
SPC25-201ENST00000282074 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms