RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614136.1

SRSF3-205, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 3, human

Gene SRSF3, Length 2,376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF3-205	ENST00000614136	IDS	P22304	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CDH13	P55290	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	STX3	Q13277	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LPAL2	Q16609	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KNTC1	P50748	2209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136		A8MT66	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PPP6C	O00743	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ITM2A	O43736	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	WNT1	P04628	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ANXA5	P08758	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	NUDT1	P36639	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ACTR1B	P42025	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CCR10	P46092	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC1A6	P48664	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	AGTR2	P50052	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PRKAA2	P54646	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ACTR1A	P61163	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	BST1	Q10588	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	OVGP1	Q12889	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FZD2	Q14332	565 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KRT33B	Q14525	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CEP68	Q76N32	757 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PIGK	Q92643	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136		A0A1W2PR77	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TOR1B	O14657	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	EML2	O95834	649 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC16A8	O95907	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C8G	P07360	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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