RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP7Q9Y680 259 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRB8 838 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 DAPL1A0PJW8 107 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM233B4DJY2 109 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 DCLK1O15075 740 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 MED31Q9Y3C7 131 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A1O15245 554 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 IRAK2O43187 625 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 MC1RQ01726 317 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 OR2AG1Q9H205 316 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD5O14737 125 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 ANO7Q6IWH7 933 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 OXR1Q8N573 874 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 M0QX08 132 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD9O00233 223 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ANXA8P13928 327 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CPN2P22792 545 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CRISP3P54108 245 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 TBX5Q99593 518 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PHF24Q9UPV7 400 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 GRK6P43250 576 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 AVPR1BP47901 424 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 GPX6P59796 221 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ERVK-21P61565 698 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 FZD4Q9ULV1 537 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PLOD2O00469 737 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 IL12BP29460 328 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 XKP51811 444 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 HMGCS1Q01581 520 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED5Q49AG3 693 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 TMBIM1Q969X1 311 aa20.89■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 PRKCGP05129 697 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ACVR2AP27037 513 aa20.88■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 GSTT2BP0CG30 244 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 DGKGP49619 791 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CHADLQ6NUI6 762 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ISPDA4D126 451 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ENGP17813 658 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CD83Q01151 205 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf66Q96MD2 445 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CST11Q9H112 138 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT4O43236 478 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 C1QTNF8P60827 252 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF234Q14588 700 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PI15O43692 258 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 NKD1Q969G9 470 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ABCG4Q9H172 646 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 H3BSA7 217 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF12O95522 483 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 EOMESO95936 686 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN2P17706 415 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PRPS1L1P21108 318 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 AMBNQ9NP70 447 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PIGVQ9NUD9 493 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PRKCHP24723 683 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SLC18A1P54219 525 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 NOGQ13253 232 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.87■□□□□ 0.93
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