RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 H7C0S8 307 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LEFTY2O00292 366 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 STX16O14662 325 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 IGSF6O95976 241 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1B1P15313 513 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A2P23975 617 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HMOX2P30519 316 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZSR9 355 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RBFAQ8N0V3 343 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OXR1Q8N573 874 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GPR26Q8NDV2 337 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LRRC58Q96CX6 371 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CMTM6Q9NX76 183 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 WWOXQ9NZC7 414 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FZD4Q9ULV1 537 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CCDC154A6NI56 674 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NOTOA8MTQ0 251 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF217O75362 1048 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB7O75635 380 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A3O75751 556 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SRCP12931 536 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 IL12AP29459 219 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA4P29622 427 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RGS4P49798 205 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP4BP51164 291 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DGKQP52824 942 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GTF2H2Q13888 395 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF7Q14155 803 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MPPE1Q53F39 396 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 EOGTQ5NDL2 527 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 Q6ZVU0 165 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SFRP1Q8N474 314 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RIN3Q8TB24 985 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ITFG1Q8TB96 612 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAM3CQ92520 227 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC29A1Q99808 456 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MTG2Q9H4K7 406 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 INPP4BO15327 924 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC4-211ENST00000492996 ID4P47928 161 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CHN2P52757 468 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HMGCS1Q01581 520 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NEK5Q6P3R8 708 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF366Q8N895 744 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CHST14Q8NCH0 376 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PPM1MQ96MI6 270 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.84□□□□□ -1.31
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