RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490800.1

CLDN1-202, Transcript of claudin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN1, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-202ENST00000490800 NOBOXO60393 691 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 DNAJC6O75061 913 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 NIPSNAP2O75323 286 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 KLHL2O95198 593 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ESR1P03372 595 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CEACAM5P06731 702 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 COL6A2P12110 1019 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CD9P21926 228 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 KELP23276 732 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 B4GALNT1Q00973 533 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ITGA9Q13797 1035 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ITIH4Q14624 930 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TERF2Q15554 542 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 BROXQ5VW32 411 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 PCSK4Q6UW60 755 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 LCA5Q86VQ0 697 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ARL14Q8N4G2 192 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TTC9Q92623 222 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 NXNL1Q96CM4 212 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 NUS1Q96E22 293 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 MAGEB18Q96M61 343 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TTC1Q99614 292 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TEX101Q9BY14 249 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 DPH1Q9BZG8 443 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 ADAM19Q9H013 955 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 WDR26Q9H7D7 661 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SMOXQ9NWM0 555 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 GALPQ9UBC7 116 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.39□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 WDR91A4D1P6 747 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 IQCF5A8MTL0 148 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 B4DGG1 531 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 PLD2O14939 933 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 B4GAT1O43505 415 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SOD1P00441 154 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 BPGMP07738 259 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SBK3P0C264 359 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CCDC166P0CW27 439 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 HGFP14210 728 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 GLB1P16278 677 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TAC1P20366 129 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SLC26A3P40879 764 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 GNPDA1P46926 289 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SEC24CP53992 1094 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 INHBCP55103 352 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TMPRSS3P57727 454 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CSHL1Q14406 222 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 PDK4Q16654 411 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 CCDC153Q494R4 210 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 NRROSQ86YC3 692 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 SVOPQ8N4V2 548 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.38□□□□□ -1.23
CLDN1-202ENST00000490800 NAT14Q8WUY8 206 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms