RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484331.5

RAPGEF4-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 4, human

TSL 4

Gene RAPGEF4, Length 547 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAPGEF4-211	ENST00000484331	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NAA20	P61599	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DSC2	Q02487	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DLG1	Q12959	904 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCNI	Q14094	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CSHL1	Q14406	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ACAP2	Q15057	778 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PDCD1	Q15116	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	OLFM1	Q99784	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	OMD	Q99983	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	VCX	Q9H320	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CWH43	Q9H720	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331		A0A1B0GVM2	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331		A0A1W2PR48	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PFDN6	O15212	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	SOAT2	O75908	522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PDE5A	O76074	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	VNN2	O95498	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	BAG2	O95816	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	LATS1	O95835	1130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	TBX18	O95935	607 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	GALT	P07902	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAPGEF4-211	ENST00000484331	HMBS	P08397	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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