RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 SERINC1Q9NRX5 453 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 RRN3Q9NYV6 651 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 TAS2R14Q9NYV8 317 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 GTSE1Q9NYZ3 720 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 IL17CQ9P0M4 197 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 WIPI2Q9Y4P8 454 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A1W2PPH5 198 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM168BA1KXE4 195 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 RRN3P2A6NIE6 340 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRDM1O75626 825 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SMIM18P0DKX4 95 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATP6V1B1P15313 513 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM11P17152 192 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC6A6P31641 620 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 GABRA5P31644 462 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHRNA3P32297 505 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATP4BP51164 291 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SUOXP51687 545 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRELPP51888 382 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 DHODHQ02127 395 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 IKQ13123 557 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF146Q15072 292 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SPECC1Q5M775 1068 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATAD3CQ5T2N8 411 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 WSCD1Q658N2 575 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 NOTUMQ6P988 496 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 FIGLAQ6QHK4 219 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 G2E3Q7L622 706 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHMP1BQ7LBR1 199 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PHC2Q8IXK0 858 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ESX1Q8N693 406 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PPFIBP2Q8ND30 876 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 AGAP11Q8TF27 550 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SSC4DQ8WTU2 575 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 NSMAFQ92636 917 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PHYHIPLQ96FC7 376 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CALML4Q96GE6 196 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 C2orf48Q96LS8 159 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 C1orf74Q96LT6 269 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 DACH2Q96NX9 599 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC3Q9BQI4 270 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 BTBD10Q9BSF8 475 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC28BQ9BUN5 200 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 DPAGT1Q9H3H5 408 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ABCD2Q9UBJ2 740 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 AMACRQ9UHK6 382 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CMAHPQ9Y471 501 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ATRXP46100 2492 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 POGZQ7Z3K3 1410 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A1W2PR77 199 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 GLTPD2A6NH11 291 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 C2orf81A6NN90 581 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SCAMP1O15126 338 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 HDAC3O15379 428 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 HS6ST1O60243 411 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZWINTO95229 277 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGKV3-11P04433 115 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACTN1P12814 892 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 SELEP16581 610 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 AOC1P19801 751 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 TNFAIP3P21580 790 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PTPN3P26045 913 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 CAMPP49913 170 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP10-10P60014 251 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 RUNX3Q13761 415 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRT33BQ14525 404 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCGF3Q3KNV8 242 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-177P-201ENST00000411257 RNLSQ5VYX0 342 aa0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 192.8 ms