RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 PYCR2Q96C36 320 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PNPOQ9NVS9 261 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KLF15Q9UIH9 416 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 A6NCN8 305 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PRR33A8MZF0 331 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 UGDHO60701 494 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CCNDBP1O95273 360 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 UROSP10746 265 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 HGFP14210 728 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GNAZP19086 355 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PKLRP30613 574 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CTSKP43235 329 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 AQP5P55064 265 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CYP2A13Q16696 494 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LCN9Q8WX39 176 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 MOCOSQ96EN8 888 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 RILPQ96NA2 401 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ASB1Q9Y576 335 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRIOO75962 3097 aa14.94□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KRT87PA6NCN2 255 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LMO7DNF2Z398 122 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 MATN2O00339 956 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 DIAPH2O60879 1101 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GPR37L1O60883 481 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PIAS2O75928 621 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 DCTN3O75935 186 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CLDN9O95484 217 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CER1O95813 267 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SYPP08247 313 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 FGF4P08620 206 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ALPPL2P10696 532 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ERGP11308 486 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ARRB2P32121 409 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SH3BP2P78314 561 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 IRF8Q02556 426 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KIF19Q2TAC6 998 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KANK2Q63ZY3 851 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CGB2Q6NT52 195 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LCTLQ6UWM7 567 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SYVN1Q86TM6 617 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 C17orf64Q86WR6 236 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 DDIASQ8IXT1 998 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 LOXL4Q96JB6 756 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CCT7Q99832 543 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 NTMT1Q9BV86 223 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SGPP1Q9BX95 441 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SNX6Q9UNH7 406 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 PCM1Q15154 2024 aa14.93□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 E7ENX8 843 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR7A17O14581 309 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 OR4F21O95013 312 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 EML2O95834 649 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KRT6AP02538 564 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KRT6BP04259 564 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 SLC19A1P41440 591 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 KRT6CP48668 564 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 HHEXQ03014 270 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TAP2Q03519 686 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 TRAF3Q13114 568 aa14.92□□□□□ -0.02
VAMP1-202ENST00000396308 GRB7Q14451 532 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms