RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 PLXDC2Q6UX71 529 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PACS1Q6VY07 963 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC36A4Q6YBV0 504 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ZFP2Q6ZN57 461 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 USP45Q70EL2 814 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TMUB2Q71RG4 321 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 Q75L30 129 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 MTSS1LQ765P7 747 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 BTN2A1Q7KYR7 527 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 LRRC8DQ7L1W4 858 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 RNF144BQ7Z419 303 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 GALNT7Q86SF2 657 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PIGZQ86VD9 579 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 AMIGO1Q86WK6 493 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 HOGA1Q86XE5 327 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 RNF130Q86XS8 419 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 NRROSQ86YC3 692 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 C2CD5Q86YS7 1000 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 DENND1CQ8IV53 801 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 BRSK2Q8IWQ3 736 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SCN4BQ8IWT1 228 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CERS5Q8N5B7 392 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 NGEFQ8N5V2 710 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 C4orf32Q8N8J7 132 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF709Q8N972 641 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SCAIQ8N9R8 606 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF383Q8NA42 475 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM116Q8NCL8 245 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 AGBL3Q8NEM8 1001 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ACVR1CQ8NER5 493 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 WFDC11Q8NEX6 87 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 NUP37Q8NFH4 326 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OR4Q3Q8NH05 313 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OR4C3Q8NH37 302 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OR5R1Q8NH85 324 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OLIG1Q8TAK6 271 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF596Q8TC21 504 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ATP8B4Q8TF62 1192 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CLEC4CQ8WTT0 213 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 COG1Q8WTW3 980 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM170AQ8WVE7 144 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ITLN1Q8WWA0 313 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SUSD6Q92537 303 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 UBXN4Q92575 508 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SNAPC3Q92966 411 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PHKBQ93100 1093 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM143Q96AN5 459 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PHF21AQ96BD5 680 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OTULINQ96BN8 352 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TIFAQ96CG3 184 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 RNF183Q96D59 192 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP1R16AQ96I34 528 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 MAGEB18Q96M61 343 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM20AQ96MK3 541 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 RUNDC3BQ96NL0 473 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 DGAT2Q96PD7 388 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TECTBQ96PL2 329 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 YME1L1Q96TA2 773 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 STACQ99469 402 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CGRRF1Q99675 332 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OLFM1Q99784 485 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CMKLR1Q99788 373 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SPIN2AQ99865 258 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 FOXC2Q99958 501 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SLX1AQ9BQ83 275 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 KXD1Q9BQD3 176 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OVOL2Q9BRP0 275 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC28BQ9BUN5 200 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 STRA6Q9BX79 667 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 OSBPL11Q9BXB4 747 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 STK31Q9BXU1 1019 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 HDHD5Q9BXW7 423 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC17A9Q9BYT1 436 aa-0.22□□□□□ -2.44
SNORD49B-201ENST00000365172 PITPNM3Q9BZ71 974 aa-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms