RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 RNF24Q9Y225 148 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ASB3Q9Y575 518 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NME7Q9Y5B8 376 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 PPCDCQ96CD2 204 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 FPGSQ05932 587 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MEF2DQ14814 521 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LPCAT4Q643R3 524 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.81□□□□□ -1.64
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