RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PSMD6	Q15008	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MEP1A	Q16819	746 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ALF	Q53S48	1182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TATDN2	Q93075	761 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772		U3KQK5	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1B0GUS0	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1B0GX78	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PSMD11	O00231	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MATN2	O00339	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MAPK13	O15264	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KLRC4	O43908	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CTSV	O60911	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PDE9A	O76083	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EPPIN	O95925	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PYGL	P06737	847 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CSF3	P09919	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	XBP1	P17861	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TNNI1	P19237	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MCM7	P33993	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFA8	P51970	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KLC1	Q07866	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FAM168A	Q92567	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1B0GVL5	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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