RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA8RI6L899 631 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TRIM38O00635 465 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 NOBOXO60393 691 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SNX2O60749 519 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 GLRA3O75311 464 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 C8GP07360 202 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CRHR1P34998 444 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CSHL1Q14406 222 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ACAP2Q15057 778 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TTMPQ5BVD1 217 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SBSNQ6UWP8 590 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 GPR156Q8NFN8 814 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 OR4C6Q8NH72 309 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1191Q96A73 305 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 NXNL1Q96CM4 212 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 APOPT1Q96IL0 206 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CENPHQ9H3R5 247 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DCDC2Q9UHG0 476 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 EFSO43281 561 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB14O43829 449 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TYROBPO43914 113 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 NDUFS1P28331 727 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TCEA2Q15560 299 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TECRLQ5HYJ1 363 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ISCA2Q86U28 154 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SPATA6LQ8N4H0 392 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 AVL9Q8NBF6 648 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DLG3Q92796 817 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 PTERQ96BW5 349 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 C12orf66Q96MD2 445 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 FOPNLQ96NB1 174 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SMC6Q96SB8 1091 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DPH1Q9BZG8 443 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 RDH14Q9HBH5 336 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 STARD5Q9NSY2 213 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 POT1Q9NUX5 634 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZNF358Q9NW07 568 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CDC7O00311 574 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 BTN3A1O00481 513 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 COPEO14579 308 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SUV39H1O43463 412 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 C1orf105O95561 183 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CATP04040 527 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 RPN2P04844 631 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ALPPL2P10696 532 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 GP1BBP13224 206 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CREB1P16220 341 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TFEBP19484 476 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SLC19A1P41440 591 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 FASLGP48023 281 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 LSSP48449 732 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CCT5P48643 541 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ABRQ12979 859 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 KLC3Q6P597 504 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB9Q96C00 473 aa16.34■□□□□ 0.21
PACS1-208ENST00000529677 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.34■□□□□ 0.21
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