RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510173.6

RBM4-208, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3

Gene RBM4, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-208	ENST00000510173	SSPN	Q14714	243 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	DLG3	Q92796	817 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	PEX13	Q92968	403 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	BLACE	A4D250	179 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	GNLY	P22749	145 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	OTX2	P32243	289 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	RAB28	P51157	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	GDF10	P55107	478 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	TMED2	Q15363	201 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM4-208	ENST00000510173	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173		A6NL46	340 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	NDC80	O14777	642 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TTI1	O43156	1089 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RAD51C	O43502	376 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SUN1	O94901	812 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	IFNB1	P01574	187 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	APOA4	P06727	396 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ADRA1D	P25100	572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	ARSF	P54793	590 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PRAME	P78395	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	BRD3	Q15059	726 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	KYNU	Q16719	465 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PTER	Q96BW5	349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	GBP5	Q96PP8	586 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	OR51F1	A6NGY5	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	AP3B1	O00203	1094 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	FKBP9	O95302	570 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	S1PR4	O95977	384 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-208	ENST00000510173	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21

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