RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.39□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.39□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 A0A087X0M5 115 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1B0GX30 115 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MPTX1A8MV57 137 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 TSPAN1O60635 241 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ZWINTO95229 277 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SEC24AO95486 1093 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 WDPCPO95876 746 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 HPRP00739 348 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 CD4P01730 458 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 GJA1P17302 382 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 TM4SF1P30408 202 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MNDAP41218 407 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 LBX1P52954 281 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 GUCY2DQ02846 1103 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 CXCL9Q07325 125 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ODF4Q2M2E3 257 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 CEP57L1Q8IYX8 460 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MED20Q9H944 212 aa3.38□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ASB14A6NK59 587 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 GLRA3O75311 464 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 CDK2AP2O75956 126 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MBD4O95243 580 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SLC9A3P48764 834 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 TNIP1Q15025 636 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 HERC3Q15034 1050 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 Q6ZR54 194 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 TTC39CQ8N584 583 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 C10orf90Q96M02 699 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 GKN1Q9NS71 199 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 NME7Q9Y5B8 376 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1W2PR80 420 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ENO4A6NNW6 628 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 B4DLN1 442 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ITIH1P19827 911 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 CDC25CP30307 473 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SLC15A1P46059 708 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 LIMK2P53671 638 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 XKR3Q5GH77 459 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 LCE3AQ5TA76 89 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 G2E3Q7L622 706 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 AACSQ86V21 672 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 HPS6Q86YV9 775 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 OR1L3Q8NH93 324 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 AGAP4Q96P64 663 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 RAD9AQ99638 391 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 NDE1Q9NXR1 346 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 GPR83Q9NYM4 423 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 STUB1Q9UNE7 303 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1W2PPR1 153 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 C2orf81A6NN90 581 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 PTGES3LE9PB15 166 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 IGKV3-15P01624 115 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 IGHEP01854 428 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 OR2T7P0C7T2 308 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 HLA-FP30511 346 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 MAPK4P31152 587 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 ACSL1P33121 698 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 HADHAP40939 763 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-202ENST00000499038 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms