RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	GABRA5	P31644	462 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	TSPAN7	P41732	249 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	MTHFR	P42898	656 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	KCNC3	Q14003	757 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	KRT32	Q14532	448 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	TNIP1	Q15025	636 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	OR6S1	Q8NH40	331 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	OR52N5	Q8NH56	324 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	LRRC15	Q8TF66	581 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	AASS	Q9UDR5	926 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP34-222	ENST00000498268	OR10H2	O60403	315 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CCNDBP1	O95273	360 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	VTN	P04004	478 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	MMP9	P14780	707 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	MAN1A1	P33908	653 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	ETV5	P41161	510 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	PDX1	P52945	283 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	DLK1	P80370	383 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TAF10	Q12962	218 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	MAPK15	Q8TD08	544 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	MED20	Q9H944	212 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	KRT84	Q9NSB2	600 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	ZNF69	Q9UC07	566 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		2.77	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	SHISA9	B4DS77	424 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	LRCH4	O75427	683 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	IGHE	P01854	428 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	SLC6A6	P31641	620 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CES4A	Q5XG92	561 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	SARM1	Q6SZW1	724 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	AACS	Q86V21	672 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CDK20	Q8IZL9	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268		Q8N7P7	452 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	SKA1	Q96BD8	255 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	C7orf26	Q96N11	449 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	MUC13	Q9H3R2	512 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	NDE1	Q9NXR1	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	ENO4	A6NNW6	628 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268		A8MXK9	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	GLRA3	O75311	464 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CDK2AP2	O75956	126 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	TMEM63A	O94886	807 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	THEGL	P0DJG4	465 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CHM	P24386	653 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	CLCN4	P51793	760 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	XG	P55808	180 aa		2.75	□□□□□ -1.97
USP34-222	ENST00000498268	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97

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