RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 FOLH1Q04609 750 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 KIAA0040Q15053 153 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LCN8Q6JVE9 175 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ARPINQ7Z6K5 226 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 EME1Q96AY2 570 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 BTBD9Q96Q07 612 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SCOCQ9UIL1 159 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AURKCQ9UQB9 309 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 IRF8Q02556 426 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NLRP8Q86W28 1048 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 YAF2Q8IY57 180 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CCDC138Q96M89 665 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FOPNLQ96NB1 174 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ASIC5Q9NY37 505 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 RFXAPO00287 272 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TIPRLO75663 272 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NCK1P16333 377 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NAE1Q13564 534 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 INPP5AQ14642 412 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FRG2Q64ET8 278 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FAM110BQ8TC76 370 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ATL1Q8WXF7 558 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FRG2BQ96QU4 278 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 VCXQ9H320 206 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GULP1Q9UBP9 304 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CDH7Q9ULB5 785 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 USP22Q9UPT9 525 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa16.28■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DHRS12A0PJE2 317 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 H3BM21 787 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LINC01565O15544 149 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AKAP10O43572 662 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LYNP07948 512 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MTPNP58546 118 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PWP1Q13610 501 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 XKR6Q5GH73 641 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CACUL1Q86Y37 369 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CGREF1Q99674 301 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PRSS16Q9NQE7 514 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AK5Q9Y6K8 562 aa16.27■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 KAT7O95251 611 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 KCNH1O95259 989 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 SLC16A8O95907 504 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 CAPNS1P04632 268 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 P2RY2P41231 377 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 MTX3Q5HYI7 312 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 TBCELQ5QJ74 424 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 RNF175Q8N4F7 328 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 PKP4Q99569 1192 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 KXD1Q9BQD3 176 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 MUC13Q9H3R2 512 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 CLMPQ9H6B4 373 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 EPHX3Q9H6B9 360 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.27■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 A6NHS1 94 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 IL6P05231 212 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 PGRP06401 933 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 JUPP14923 745 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 CNTN1Q12860 1018 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 SELPLGQ14242 412 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.26■□□□□ 0.19
TOM1-216ENST00000492723 BCL7AQ4VC05 210 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms