RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 LDB2O43679 373 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ELNP15502 786 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.35e-11■□□□□ 9
NISCH-212ENST00000488380 MBTPS1Q14703 1052 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TBRG1Q3YBR2 411 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 BCL7AQ4VC05 210 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 LYPD8Q6UX82 237 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ZNF583Q96ND8 569 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CDK15Q96Q40 435 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 GALPQ9UBC7 116 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 METTL15A6NJ78 407 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 HSMCR30P0CW71 290 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TYMPP19971 482 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 GADD45AP24522 165 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 LIPAP38571 399 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 AGTR2P50052 363 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 P2RX3P56373 397 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TUBA1BP68363 451 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ZNF45Q02386 682 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 DLEU7Q6UYE1 221 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TUBA1AQ71U36 451 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TRIM63Q969Q1 353 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 C1orf74Q96LT6 269 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SEMA3CQ99985 751 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 DUSP21Q9H596 190 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 MROH6A6NGR9 719 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 WASH4PA8MWX3 477 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 RGS5O15539 181 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 G6PDP11413 515 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 MTHFD2P13995 350 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 RHOQP17081 205 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PRKACBP22694 351 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PBX3P40426 434 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ERVK-8P63133 956 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 GALK2Q01415 458 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PRKCZQ05513 592 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PRSS48Q7RTY5 328 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 NRARPQ7Z6K4 114 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 OR2T11Q8NH01 316 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PRRG3Q9BZD7 231 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R9Q9NYW1 312 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 VAPAQ9P0L0 249 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 A0A0D9SEW6 157 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 GATMP50440 423 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ARHGDIAP52565 204 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CYP4F2P78329 520 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CYP4F3Q08477 520 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 C10orf120Q5SQS8 335 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A4Q969I6 547 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 Q96MT0 163 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 APOL4Q9BPW4 351 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 RNF6Q9Y252 685 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PKP3Q9Y446 797 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 A0A0U1RQS6 177 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SLC12A8A0AV02 714 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ARVCFO00192 962 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CXCR6O00574 342 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SEPT4O43236 478 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 DIRAS1O95057 198 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 HTR7P34969 479 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SLC15A1P46059 708 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TAF10Q12962 218 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 RFX4Q33E94 735 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TRIM60Q495X7 471 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 NADSYN1Q6IA69 706 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SYVN1Q86TM6 617 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 UROC1Q96N76 676 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PHOX2BQ99453 314 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 KCNS3Q9BQ31 491 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ITPAQ9BY32 194 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 FBXL12Q9NXK8 326 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms