RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479230.5

GNL3-208, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 4

Gene GNL3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	NR2F1	P10589	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DNASE1	P24855	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	LIG4	P49917	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	HSPA2	P54652	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TEAD2	Q15562	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ART5	Q96L15	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	FANCA	O15360	1455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230		A0A087WW49	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	RAF1	P04049	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	RAD52	P43351	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	UBXN2A	P68543	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	BECN1	Q14457	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DHX58	Q96C10	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MEIS2	O14770	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	KLF11	O14901	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	AKR1B1	P15121	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PFKFB1	P16118	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CEBPB	P17676	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MAGEA11	P43364	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	BMX	P51813	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PPARD	Q03181	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	HSPB3	Q12988	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM187	Q14656	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SUSD6	Q92537	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	PLCH2	O75038	1416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	NEO1	Q92859	1461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230		A0A1W2PPE2	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GNL3-208	ENST00000479230		A0A1W2PR64	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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