RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	USP22	Q9UPT9	525 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ITM2B	Q9Y287	266 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	BTRC	Q9Y297	605 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	IPP	Q9Y573	584 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032		A0A0G2JMP0	313 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CENPX	A8MT69	81 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	LACTBL1	A8MY62	500 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032		C9JVG2	144 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032		E9PQ18	207 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032		H0Y626	953 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032		J3QL48	77 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	KCNK1	O00180	336 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ARVCF	O00192	962 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ARNTL	O00327	626 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CTDSP2	O14595	271 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	DSCR3	O14972	297 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CA12	O43570	354 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	RGS10	O43665	173 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	XPNPEP2	O43895	674 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NBN	O60934	754 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ATP6AP2	O75787	350 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SEMA3D	O95025	777 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	MED26	O95402	600 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	F9	P00740	461 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CYBB	P04839	570 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ASNS	P08243	561 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SERPINF2	P08697	491 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	IL7	P13232	177 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	HGF	P14210	728 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NPR1	P16066	1061 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CD36	P16671	472 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NAGA	P17050	411 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ERCC2	P18074	760 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	IL1RN	P18510	177 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	PAM	P19021	973 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CYP2A7	P20853	494 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	FMO3	P31513	532 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	DCT	P40126	519 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	MATK	P42679	507 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CTSK	P43235	329 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	OR3A3	P47888	321 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	PPP3CC	P48454	512 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NRIP1	P48552	1158 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	HCAR3	P49019	387 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SULT1E1	P49888	294 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SEPHS1	P49903	392 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	PLK1	P53350	603 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	LIMK1	P53667	647 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	HSPA2	P54652	639 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	BCAT1	P54687	386 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	AIF1	P55008	147 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	GPR85	P60893	370 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	HERVK_113	P63132	956 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TSPY1	Q01534	308 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	BNC1	Q01954	994 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SP4	Q02446	784 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	FPGS	Q05932	587 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	RING1	Q06587	406 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	RAD51	Q06609	339 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	ZNF33A	Q06730	810 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SCAP	Q12770	1279 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	CTBP1	Q13363	440 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	RAPSN	Q13702	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	STARD3	Q14849	445 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	RPS6KA2	Q15349	733 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	NKG7	Q16617	165 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	KYAT1	Q16773	422 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	FAM187B	Q17R55	369 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BBX-222	ENST00000472032	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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