RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462548.6

RPRD1B-203, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 5

Gene RPRD1B, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-203ENST00000462548 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.57□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 OXTRP30559 389 aa14.57□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PRKG2Q13237 762 aa14.57□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.57□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 KLHL29Q96CT2 875 aa14.57□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.57□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 OR2M4Q96R27 311 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 ACTR8Q9H981 624 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 CHEK2O96017 543 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 CD22P20273 847 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 CLCA4Q14CN2 919 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 DEFB119Q8N690 84 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.56□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 KLQ9UEF7 1012 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 LRP4O75096 1905 aa14.56□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 E7EQ34 232 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PEX11AO75192 247 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF217O75362 1048 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 KRT34O76011 436 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 SFRP1Q8N474 314 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 E7ENX8 843 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 EML2O95834 649 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 YPEL5P62699 121 aa14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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RPRD1B-203ENST00000462548 VCANP13611 3396 aa14.55□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 A0A1W2PPC4 97 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 WFS1O76024 890 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 COX4I1P13073 169 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 LBPP18428 481 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 KELP23276 732 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 HTR1BP28222 390 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PTPN4P29074 926 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 THOP1P52888 689 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PNLIPRP1P54315 467 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 CTBSQ01459 385 aa14.54□□□□□ -0.08
RPRD1B-203ENST00000462548 SGO1Q5FBB7 561 aa14.54□□□□□ -0.08
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