RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447609.5

LMO3-209, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,365 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-209ENST00000447609 TMCC2O75069 709 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 INMTO95050 263 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 RHOCP08134 193 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CD36P16671 472 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GPX3P22352 226 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SLC6A2P23975 617 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 VIPR2P41587 438 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 OR3A3P47888 321 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SLC9A3P48764 834 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CLCN4P51793 760 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CLCN5P51795 746 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 DAOAP59103 153 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 NPTX1Q15818 432 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CARTPTQ16568 116 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CA9Q16790 459 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GLYATQ6IB77 296 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GPR149Q86SP6 731 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 NOXA1Q86UR1 476 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GPR65Q8IYL9 337 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 FGF13Q92913 245 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SMARCD2Q92925 531 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 YIPF6Q96EC8 236 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SHDQ96IW2 340 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SLC30A3Q99726 388 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 EHD3Q9NZN3 535 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CCDC182A6NF36 153 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 EPOPA6NHQ4 379 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 METTL15A6NJ78 407 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 DFFAO00273 331 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PLK4O00444 970 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 GABRDO14764 452 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 MAP3K6O95382 1288 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SLC35E2BP0CK96 405 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ITGAMP11215 1152 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 IL4RP24394 825 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 VBP1P61758 197 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 IFITM3Q01628 133 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CD47Q08722 323 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CLCA4Q14CN2 919 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ACAP2Q15057 778 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 MEP1AQ16819 746 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ESCO2Q56NI9 601 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PCID2Q5JVF3 399 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ZNF691Q5VV52 312 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CES3Q6UWW8 571 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 STRADAQ7RTN6 431 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TRIM69Q86WT6 500 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CACUL1Q86Y37 369 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 OR8H2Q8N162 312 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 METTL4Q8N3J2 472 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PJA1Q8NG27 643 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 FAR1Q8WVX9 515 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 MYDGFQ969H8 173 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TCEAL4Q96EI5 215 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 ZBTB18Q99592 522 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CMTM6Q9NX76 183 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 CFL2Q9Y281 166 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.35□□□□□ -1.55
LMO3-209ENST00000447609 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.1 ms