RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF350Q9GZX5 532 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCG8Q9H221 673 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR26Q9H7D7 661 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OPTCQ9UBM4 332 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX6Q9UNH7 406 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMD13Q9UNM6 376 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM170BA6NMN3 283 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 L7N2F9 121 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NR5A2O00482 541 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CES2O00748 559 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 WNT9AO14904 365 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEB3O15480 346 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OIP5O43482 229 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF217O75362 1048 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TCEA3O75764 348 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PNPP00491 289 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PROCP04070 461 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNA4P05014 189 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MPOP05164 745 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SYPP08247 313 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DRD1P21728 446 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NTSR1P30989 418 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GRK5P34947 590 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ALDH9A1P49189 494 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS2R40P59535 323 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM3P62310 102 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MOGSQ13724 837 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DHCR24Q15392 516 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GRK1Q15835 563 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SNAPC1Q16533 368 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM153CQ494X1 144 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF220Q5VTB9 566 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TCEAL6Q6IPX3 200 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZVU0 165 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SSX9Q7RTT3 188 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NETO2Q8NC67 525 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HDAC10Q969S8 669 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 APOPT1Q96IL0 206 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF599Q96NL3 588 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM237Q96Q45 408 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RHBGQ9H310 441 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHST7Q9NS84 486 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DHRS7Q9Y394 339 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MYH1P12882 1939 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MYH3P11055 1940 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM38O00635 465 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CASKO14936 926 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MFSD11O43934 449 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TIPRLO75663 272 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TGM6O95932 706 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFP01375 233 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ITGA2P17301 1181 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FGFR3P22607 806 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OXTRP30559 389 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CLCN5P51795 746 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CTBP2P56545 445 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CDKL1Q00532 357 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DSC2Q02487 901 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CREB5Q02930 508 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF844Q08AG5 666 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FXNQ16595 210 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NRF1Q16656 503 aa4.33□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB12Q6IQ22 244 aa4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms