RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 E2F2Q14209 437 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 PTK2BQ14289 1009 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 NFATC4Q14934 902 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 NAA25Q14CX7 972 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 PYCR3Q53H96 274 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.53□□□□□ -0.88
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POLR1A-202ENST00000409024 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 CACUL1Q86Y37 369 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.53□□□□□ -0.88
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POLR1A-202ENST00000409024 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.53□□□□□ -0.88
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POLR1A-202ENST00000409024 PGBD3Q8N328 593 aa9.53□□□□□ -0.88
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POLR1A-202ENST00000409024 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 NAT14Q8WUY8 206 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 HMGB4Q8WW32 186 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 MIPEPQ99797 713 aa9.53□□□□□ -0.88
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POLR1A-202ENST00000409024 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 ACSS2Q9NR19 701 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.885e-7■■■■□ 24.2
POLR1A-202ENST00000409024 NDE1Q9NXR1 346 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 NCDNQ9UBB6 729 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 EBF1Q9UH73 591 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 POLG2Q9UHN1 485 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF225Q9UK10 706 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-202ENST00000409024 SNX6Q9UNH7 406 aa9.53□□□□□ -0.88
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POLR1A-202ENST00000409024 DYTNA2CJ06 578 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 FAM170BA6NMN3 283 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 E9PBE3 544 aa9.52□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 CLGNO14967 610 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PIP5K1BO14986 540 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SLC31A1O15431 190 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 RGS14O43566 566 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL41O60662 606 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ULK1O75385 1050 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CBX6O95503 412 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CAPN1P07384 714 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SP9P0CG40 484 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ERGP11308 486 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 HSD3B1P14060 373 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 IDO1P14902 403 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ACPPP15309 386 aa9.52□□□□□ -0.89
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POLR1A-202ENST00000409024 CD72P21854 359 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 IDSP22304 550 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 HSD3B2P26439 372 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFS1P28331 727 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 FOXA1P55317 472 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PPP2CBP62714 309 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ERVK-8P63133 956 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PPP2CAP67775 309 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 DMWDQ09019 674 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 LAPTM5Q13571 262 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 NFE2L1Q14494 772 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 DOK6Q6PKX4 331 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 XKR5Q6UX68 686 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 TREML1Q86YW5 311 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 DDIASQ8IXT1 998 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.52□□□□□ -0.89
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