RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399598.6

UBXN2B-201, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN2B, Length 5,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-201ENST00000399598 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TMBIM1Q969X1 311 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CERS4Q9HA82 394 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GIN1Q9NXP7 522 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 DCLK1O15075 740 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 PTPN2P17706 415 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CPN2P22792 545 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ERVK-21P61565 698 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 BNIP3Q12983 259 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ADGRF1Q5T601 910 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 IQCHQ86VS3 1027 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 FCGR1BQ92637 280 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 FAM210AQ96ND0 272 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 KLF11O14901 512 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 S100A1P23297 94 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 S100GP29377 79 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 HOXD13P35453 343 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GNALP38405 381 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 AVPR1BP47901 424 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CREB5Q02930 508 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 VITQ6UXI7 678 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 AMZ2Q86W34 360 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 HERVK_113Q902F9 699 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 UFD1Q92890 307 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ACDQ96AP0 544 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GLTPD2A6NH11 291 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CRISP3P54108 245 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC18A2Q05940 514 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ARHGAP1Q07960 439 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SCARB2Q14108 478 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 DLK2Q6UY11 383 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 LGI4Q8N135 537 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 PIK3R3Q92569 461 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TRIM2Q9C040 744 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ENGP17813 658 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 DNASE1L1P49184 302 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GPR151Q8TDV0 419 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TBX5Q99593 518 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 MIPEPQ99797 713 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 KCTD3Q9Y597 815 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 H3BSA7 217 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 PRAMEF10O60809 474 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CYP11A1P05108 521 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 AOC1P19801 751 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GDF5P43026 501 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 HCAR3P49019 387 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 KCNQ1P51787 676 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 GPR22Q99680 433 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CDH7Q9ULB5 785 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 A0A1W2PRU2 124 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 COLEC12Q5KU26 742 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 IDNKQ5T6J7 187 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 TMCO6Q96DC7 493 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 KCNC2Q96PR1 638 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 FZD4Q9ULV1 537 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 NRP1O14786 923 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SEC13P55735 322 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 MC1RQ01726 317 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 CHRNA6Q15825 494 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 FRG2Q64ET8 278 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN2B-201ENST00000399598 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms