RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 COG4Q9H9E3 785 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM60AQ9NP50 221 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IL17CQ9P0M4 197 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TINAGQ9UJW2 476 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf18Q9UK00 162 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PPT2Q9UMR5 302 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ASF1AQ9Y294 204 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MTORP42345 2549 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 APOL1O14791 398 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 SUN1O94901 812 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP9O95302 570 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CRTAMO95727 393 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 RPN2P04844 631 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-10P10266 1014 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CD46P15529 392 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DNASE1P24855 282 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN3P26045 913 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX11P35716 441 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GBE1Q04446 702 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF33BQ06732 778 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB17Q13105 803 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKG2Q13237 762 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA25Q14CX7 972 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX44Q53QW1 395 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF766Q5HY98 468 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BIVMQ86UB2 503 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTD1Q8N815 330 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.53□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.53□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf60A6NFR6 353 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 USP27XA6NNY8 438 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BMH7 237 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK2AP1O14519 115 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AURKAO14965 403 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AP2A2O94973 939 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 MST1P26927 711 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX19P40855 299 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 IST1P53990 364 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 EMP2P54851 167 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 KLC1Q07866 573 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP3Q13368 585 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MUM1Q2TAK8 710 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SYTL3Q4VX76 610 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC23LQ6PF05 361 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM73Q86UV7 250 aa7.52□□□□□ -1.21
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