RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 GPR42O15529 346 aa14.91□□□□□ -0.02
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SF3B4-201ENST00000271628 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 C1orf109Q9NX04 203 aa14.89□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 ASIC5Q9NY37 505 aa14.89□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 CD300AQ9UGN4 299 aa14.89□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 CKAP5Q14008 2032 aa14.88□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 MGAT4DA6NG13 374 aa14.88□□□□□ -0.03
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