RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 ATP2B3Q16720 1220 aa12□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 RNF214Q8ND24 703 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 AOX1Q06278 1338 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 USP48Q86UV5 1035 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.99□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 KIF3AQ9Y496 699 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 MX1P20591 662 aa11.98□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 STAP2Q9UGK3 403 aa11.98□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 USP25Q9UHP3 1055 aa11.98□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 CHMLP26374 656 aa11.96□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 CDK19Q9BWU1 502 aa11.96□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.96□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.96□□□□□ -0.5
HCG18-242ENST00000602319 NEO1Q92859 1461 aa11.96□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 AP5Z1O43299 807 aa11.95□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 CABP1Q9NZU7 370 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-242ENST00000602319 HMMRO75330 724 aa11.94□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 CBX1P83916 185 aa11.92□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-242ENST00000602319 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.53e-7■■■□□ 16.5
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HCG18-242ENST00000602319 USP54Q70EL1 1684 aa11.9□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 F13A1P00488 732 aa11.9□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 IL25Q9H293 177 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 STK26Q9P289 416 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 KCNA4P22459 653 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 DIP2AQ14689 1571 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 STX6O43752 255 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 GGT6Q6P531 493 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 ARID3AQ99856 593 aa11.88□□□□□ -0.51
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