RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 DLG5Q8TDM6 1919 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 PROM2Q8N271 834 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 LGR6Q9HBX8 967 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 PALLDQ8WX93 1383 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 TEFQ10587 303 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 MRS2Q9HD23 443 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 NFE2L2Q16236 605 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 RUNDC1Q96C34 613 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 MRC1P22897 1456 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 IL17REQ8NFR9 667 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 ATG3Q9NT62 314 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-224ENST00000551155 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 STK32BQ9NY57 414 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 C5P01031 1676 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 SIK1P57059 783 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 RIPK4P57078 832 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 CCDC184Q52MB2 194 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 PAPPAQ13219 1627 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 MCM10Q7L590 875 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 ATP6V1AP38606 617 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 SLC15A2Q16348 729 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 BTBD11A6QL63 1104 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 KCNQ4P56696 695 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 NEUROD2Q15784 382 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 CCER2I3L3R5 266 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 DCTN1Q14203 1278 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 ZNF790Q6PG37 636 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-224ENST00000551155 C4BP0C0L5 1744 aa12.28□□□□□ -0.44
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CS-224ENST00000551155 SLC39A6Q13433 755 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 AKT1S1Q96B36 256 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 AK7Q96M32 723 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 FMNL2Q96PY5 1086 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 BABAM1Q9NWV8 329 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 ITPK1Q13572 414 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 ZNF827Q17R98 1081 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 TJP1Q07157 1748 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 UBR3Q6ZT12 1888 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 LINC00116Q8NCU8 138 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 CASZ1Q86V15 1759 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 STARD3NLO95772 234 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 NGEFQ8N5V2 710 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 SSFA2P28290 1259 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 CCDC27Q2M243 656 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 GNPATO15228 680 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 RPS6KA4O75676 772 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-224ENST00000551155 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
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