RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551124.5

IKZF4-211, Transcript of IKAROS family zinc finger 4, human

TSL 1 (best)

Gene IKZF4, Length 4,396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IKZF4-211	ENST00000551124	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	FIBP	O43427	364 aa		11.47	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	FLII	Q13045	1269 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.46	□□□□□ -0.57
IKZF4-211	ENST00000551124	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ATP10B	O94823	1461 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	MCM2	P49736	904 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF76	P36508	570 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	RABEP1	Q15276	862 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NAPB	Q9H115	298 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	GRM1	Q13255	1194 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	SLC5A1	P13866	664 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	PLCH2	O75038	1416 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	GC	P02774	474 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	KIF14	Q15058	1648 aa		11.44	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	RNF214	Q8ND24	703 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ME1	P48163	572 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	PDILT	Q8N807	584 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	FEZ1	Q99689	392 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	IL2RB	P14784	551 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	A2M	P01023	1474 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	MX1	P20591	662 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	KRT32	Q14532	448 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ST5	P78524	1137 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CDKL5	O76039	1030 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	TBX22	Q9Y458	520 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.4	□□□□□ -0.58
IKZF4-211	ENST00000551124	ORAI2	Q96SN7	254 aa		11.4	□□□□□ -0.58

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