RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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CCL20-204ENST00000489160 SCNN1DP51172 638 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-204ENST00000489160 GDF10P55107 478 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-204ENST00000489160 KCNA1Q09470 495 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-204ENST00000489160 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-204ENST00000489160 TMEM229AB2RXF0 380 aa9□□□□□ -0.97
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CCL20-204ENST00000489160 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
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CCL20-204ENST00000489160 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.98□□□□□ -0.97
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PRU2 124 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL20-204ENST00000489160 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 OCLNQ16625 522 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL20-204ENST00000489160 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL20-204ENST00000489160 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.94□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 CNKSR1Q969H4 720 aa8.93□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.93□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL20-204ENST00000489160 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.9□□□□□ -0.98
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CCL20-204ENST00000489160 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CCL20-204ENST00000489160 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CCL20-204ENST00000489160 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.86□□□□□ -0.99
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CCL20-204ENST00000489160 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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