RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 MCM4P33991 863 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD62A6NC57 917 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CBFA2T2O43439 604 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 FAM193AP78312 1265 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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PTPRF-209ENST00000438120 CHMP4BP1P59074 171 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 WASF1Q92558 559 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 ERLIN2O94905 339 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTPRF-209ENST00000438120 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 GPTP24298 496 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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PTPRF-209ENST00000438120 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 CFAP100Q494V2 611 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 PRXQ9BXM0 1461 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 RAB11FIP3O75154 756 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 MAP3K11Q16584 847 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 A0A087WZG4 1122 aa20.08■□□□□ 0.81
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PTPRF-209ENST00000438120 PPFIA3O75145 1194 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-209ENST00000438120 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 SMTNL1A8MU46 457 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 FAM83GA6ND36 823 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 UQCRHP07919 91 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 MAP3K12Q12852 859 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 FBLN1P23142 703 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC96Q2M329 555 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 C8orf76Q96K31 380 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 SNRKQ9NRH2 765 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF213O14771 459 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CD109Q6YHK3 1445 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 TOP2BQ02880 1626 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRF-209ENST00000438120 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 TRIM27P14373 513 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRF-209ENST00000438120 FLIIQ13045 1269 aa20.04■□□□□ 0.8
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